Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3DO95716 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3DO95716 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3DO95716 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3DO95716 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3DO95716 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3DO95716 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3DO95716 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3DO95716 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3DO95716 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3DO95716 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3DO95716 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3DO95716 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3DO95716 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3DO95716 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3DO95716 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3DO95716 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3DO95716 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3DO95716 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3DO95716 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3DO95716 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms