Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR1AO95602 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
POLR1AO95602 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLR1AO95602 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLR1AO95602 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
POLR1AO95602 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms