Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPTXRO95502 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPTXRO95502 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPTXRO95502 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NPTXRO95502 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPTXRO95502 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPTXRO95502 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPTXRO95502 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms