Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSCO60682 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSCO60682 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSCO60682 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSCO60682 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSCO60682 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSCO60682 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSCO60682 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MSCO60682 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSCO60682 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSCO60682 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSCO60682 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSCO60682 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSCO60682 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSCO60682 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSCO60682 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MSCO60682 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSCO60682 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSCO60682 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSCO60682 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MSCO60682 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MSCO60682 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSCO60682 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MSCO60682 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MSCO60682 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSCO60682 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MSCO60682 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MSCO60682 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSCO60682 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MSCO60682 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSCO60682 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MSCO60682 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSCO60682 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSCO60682 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSCO60682 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSCO60682 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSCO60682 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSCO60682 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSCO60682 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MSCO60682 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSCO60682 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSCO60682 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSCO60682 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSCO60682 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSCO60682 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSCO60682 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSCO60682 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MSCO60682 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSCO60682 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSCO60682 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSCO60682 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSCO60682 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSCO60682 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSCO60682 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSCO60682 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSCO60682 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSCO60682 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSCO60682 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSCO60682 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSCO60682 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSCO60682 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSCO60682 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSCO60682 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSCO60682 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSCO60682 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSCO60682 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSCO60682 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSCO60682 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSCO60682 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSCO60682 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSCO60682 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSCO60682 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSCO60682 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSCO60682 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSCO60682 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSCO60682 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSCO60682 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSCO60682 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSCO60682 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSCO60682 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSCO60682 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSCO60682 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms