Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN1O60635 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN1O60635 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN1O60635 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN1O60635 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms