Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNCRIPO60506 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNCRIPO60506 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCRIPO60506 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCRIPO60506 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms