Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDIL3O43854 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDIL3O43854 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDIL3O43854 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDIL3O43854 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDIL3O43854 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms