Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUX1O43812 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUX1O43812 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUX1O43812 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUX1O43812 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX1O43812 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX1O43812 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX1O43812 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX1O43812 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DUX1O43812 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUX1O43812 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DUX1O43812 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUX1O43812 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUX1O43812 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUX1O43812 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUX1O43812 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUX1O43812 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUX1O43812 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUX1O43812 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUX1O43812 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUX1O43812 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUX1O43812 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUX1O43812 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUX1O43812 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUX1O43812 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUX1O43812 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUX1O43812 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUX1O43812 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUX1O43812 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DUX1O43812 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUX1O43812 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUX1O43812 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX1O43812 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX1O43812 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX1O43812 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUX1O43812 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUX1O43812 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DUX1O43812 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUX1O43812 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUX1O43812 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUX1O43812 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUX1O43812 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUX1O43812 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUX1O43812 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUX1O43812 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUX1O43812 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUX1O43812 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX1O43812 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX1O43812 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX1O43812 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUX1O43812 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUX1O43812 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUX1O43812 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUX1O43812 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DUX1O43812 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DUX1O43812 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUX1O43812 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUX1O43812 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUX1O43812 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUX1O43812 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUX1O43812 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUX1O43812 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUX1O43812 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUX1O43812 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUX1O43812 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUX1O43812 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUX1O43812 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUX1O43812 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUX1O43812 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUX1O43812 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUX1O43812 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUX1O43812 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUX1O43812 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX1O43812 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX1O43812 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUX1O43812 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUX1O43812 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUX1O43812 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUX1O43812 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUX1O43812 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms