Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRKAB2O43741 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRKAB2O43741 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRKAB2O43741 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRKAB2O43741 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRKAB2O43741 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms