Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKX2-8O15522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKX2-8O15522 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX2-8O15522 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms