Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC16AO15027 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16AO15027 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms