Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
APAF1O14727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
APAF1O14727 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
APAF1O14727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
APAF1O14727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
APAF1O14727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
APAF1O14727 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
APAF1O14727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
APAF1O14727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
APAF1O14727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
APAF1O14727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
APAF1O14727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
APAF1O14727 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
APAF1O14727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
APAF1O14727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
APAF1O14727 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APAF1O14727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
APAF1O14727 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
APAF1O14727 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
APAF1O14727 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
APAF1O14727 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
APAF1O14727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
APAF1O14727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
APAF1O14727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
APAF1O14727 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APAF1O14727 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
APAF1O14727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
APAF1O14727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
APAF1O14727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
APAF1O14727 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APAF1O14727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APAF1O14727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
APAF1O14727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APAF1O14727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APAF1O14727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
APAF1O14727 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
APAF1O14727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
APAF1O14727 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
APAF1O14727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
APAF1O14727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
APAF1O14727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
APAF1O14727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
APAF1O14727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
APAF1O14727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APAF1O14727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APAF1O14727 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APAF1O14727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APAF1O14727 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
APAF1O14727 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
APAF1O14727 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APAF1O14727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
APAF1O14727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
APAF1O14727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APAF1O14727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APAF1O14727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APAF1O14727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
APAF1O14727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
APAF1O14727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
APAF1O14727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
APAF1O14727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
APAF1O14727 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APAF1O14727 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
APAF1O14727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
APAF1O14727 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
APAF1O14727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
APAF1O14727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
APAF1O14727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
APAF1O14727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
APAF1O14727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
APAF1O14727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
APAF1O14727 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
APAF1O14727 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
APAF1O14727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms