Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP1O14524 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEMP1O14524 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP1O14524 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP1O14524 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEMP1O14524 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms