Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC188H7C350 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC188H7C350 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC188H7C350 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC188H7C350 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms