Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NACAE9PAV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms