Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF3BA8MYP8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF3BA8MYP8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF3BA8MYP8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF3BA8MYP8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms