Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC169A6NNP5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC169A6NNP5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC169A6NNP5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC169A6NNP5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms