Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
USP17L4A6NCW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP17L4A6NCW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP17L4A6NCW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
USP17L4A6NCW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
USP17L4A6NCW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms