Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP69A5D8W1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP69A5D8W1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP69A5D8W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP69A5D8W1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP69A5D8W1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms