Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POTEFA5A3E0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POTEFA5A3E0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POTEFA5A3E0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POTEFA5A3E0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POTEFA5A3E0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POTEFA5A3E0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POTEFA5A3E0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POTEFA5A3E0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms