Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCDC2BA2VCK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCDC2BA2VCK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCDC2BA2VCK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCDC2BA2VCK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms