Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2PPK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PPK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms