Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMF1-BGLAPU3KQ54 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms