Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H1

CHCHD2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2Q9Y6H1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD2Q9Y6H1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD2Q9Y6H1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHCHD2Q9Y6H1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2Q9Y6H1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2Q9Y6H1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms