Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCTD3Q9Y597 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCTD3Q9Y597 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD3Q9Y597 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD3Q9Y597 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD3Q9Y597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD3Q9Y597 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD3Q9Y597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD3Q9Y597 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms