Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YIPF1Q9Y548 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
YIPF1Q9Y548 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YIPF1Q9Y548 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YIPF1Q9Y548 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms