Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms