Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH3Q9ULD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH3Q9ULD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNH3Q9ULD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNH3Q9ULD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms