Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ADAM28Q9UKQ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ADAM28Q9UKQ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ADAM28Q9UKQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ADAM28Q9UKQ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms