Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PILRAQ9UKJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PILRAQ9UKJ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PILRAQ9UKJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PILRAQ9UKJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PILRAQ9UKJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PILRAQ9UKJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PILRAQ9UKJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PILRAQ9UKJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms