Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APPL1Q9UKG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APPL1Q9UKG1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APPL1Q9UKG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APPL1Q9UKG1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms