Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TSKSQ9UJT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSKSQ9UJT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TSKSQ9UJT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSKSQ9UJT2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms