Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFF4Q9UHB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AFF4Q9UHB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AFF4Q9UHB7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFF4Q9UHB7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms