Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GDAP2Q9NXN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GDAP2Q9NXN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDAP2Q9NXN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDAP2Q9NXN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDAP2Q9NXN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms