Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX7

KBTBD4, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD4Q9NVX7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD4Q9NVX7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD4Q9NVX7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KBTBD4Q9NVX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KBTBD4Q9NVX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KBTBD4Q9NVX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KBTBD4Q9NVX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KBTBD4Q9NVX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KBTBD4Q9NVX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms