Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 211.61□□□□□ -0.558e-12■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 418.14■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 37.5□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.484e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-202ENST00000528798 469 ntTSL 216.85■□□□□ 0.294e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-205ENST00000534386 1039 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-15■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-12■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-12■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 213.8□□□□□ -0.24e-12■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 26.2□□□□□ -1.424e-12■■■■□ 20.3
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 228.17■■■□□ 2.16e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 327.58■■■□□ 2.016e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)23.2■■□□□ 1.36e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 521.31■■□□□ 16e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.876e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 516.57■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.2
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 20.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 53.96□□□□□ -1.786e-7■■■■□ 20.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -26e-7■■■■□ 20.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.086e-7■■■■□ 20.1
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 515.17■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-212ENST00000512041 694 ntTSL 310.4□□□□□ -0.741e-9■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-209ENST00000508009 451 ntTSL 56.84□□□□□ -1.311e-9■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.542e-13■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 318.54■□□□□ 0.562e-13■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-13■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-13■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-13■■■■□ 20
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 19.9
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 19.9
APOBEC3CQ9NRW3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-10■■■■□ 19.9
APOBEC3CQ9NRW3 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 211.26□□□□□ -0.611e-10■■■■□ 19.9
APOBEC3CQ9NRW3 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 28.67□□□□□ -1.021e-10■■■■□ 19.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.395e-9■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.315e-9■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 333.1■■■□□ 2.895e-8■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.545e-8■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.085e-8■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-14■■■■□ 19.8
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 54.55□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA1-203ENST00000524606 646 ntTSL 23.23□□□□□ -1.892e-7■■■■□ 19.7
APOBEC3CQ9NRW3 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 19.6
APOBEC3CQ9NRW3 MRPS18B-208ENST00000472267 1610 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 19.6
APOBEC3CQ9NRW3 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 310□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 19.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 317.93■□□□□ 0.465e-6■■■■□ 19.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-6■■■■□ 19.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 59.03□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 19.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.165e-6■■■■□ 19.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 224.74■■□□□ 1.551e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 522.07■■□□□ 1.121e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 SYMPK-211ENST00000598364 995 ntTSL 316.4■□□□□ 0.221e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 215.25■□□□□ 0.031e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 314.03□□□□□ -0.161e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.121e-8■■■■□ 19.4
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 517.27■□□□□ 0.365e-9■■■■□ 19.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.145e-9■■■■□ 19.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 214.03□□□□□ -0.165e-9■■■■□ 19.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 58.02□□□□□ -1.135e-9■■■■□ 19.3
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 26.61□□□□□ -1.355e-9■■■■□ 19.3
APOBEC3CQ9NRW3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.773e-9■■■□□ 19.2
APOBEC3CQ9NRW3 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-9■■■□□ 19.2
APOBEC3CQ9NRW3 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-9■■■□□ 19.2
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-14■■■□□ 19.2
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-19■■■□□ 19.1
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 55.4□□□□□ -1.542e-19■■■□□ 19.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-206ENST00000525717 1257 ntTSL 323.02■■□□□ 1.284e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-204ENST00000524762 763 ntTSL 320.72■□□□□ 0.914e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-208ENST00000527421 1085 ntTSL 520.38■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-215ENST00000533476 1912 ntTSL 219.08■□□□□ 0.644e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.614e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-207ENST00000526919 759 ntTSL 317.95■□□□□ 0.464e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-213ENST00000532904 2073 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-217ENST00000534176 943 ntTSL 316.97■□□□□ 0.314e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.184e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-205ENST00000525004 482 ntTSL 315□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 520.1■□□□□ 0.812e-17■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-17■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-17■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 BLVRB-204ENST00000601346 676 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-17■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 318.23■□□□□ 0.517e-8■■■□□ 19
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.495e-7■■■□□ 18.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.475e-7■■■□□ 18.8
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 32.8 ms