Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSU72Q9NP77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSU72Q9NP77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSU72Q9NP77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSU72Q9NP77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SSU72Q9NP77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms