Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC40A1Q9NP59 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC40A1Q9NP59 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC40A1Q9NP59 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC40A1Q9NP59 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms