Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRHQ9HD43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRHQ9HD43 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRHQ9HD43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRHQ9HD43 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRHQ9HD43 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRHQ9HD43 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms