Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRA1Q9HD15 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRA1Q9HD15 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRA1Q9HD15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms