Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SCAPERQ9BY12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SCAPERQ9BY12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAPERQ9BY12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SCAPERQ9BY12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SCAPERQ9BY12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SCAPERQ9BY12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SCAPERQ9BY12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms