Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD1Q9BUP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHD1Q9BUP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD1Q9BUP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms