Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF4Q9BQW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF4Q9BQW3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF4Q9BQW3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF4Q9BQW3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF4Q9BQW3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms