Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LPIN3Q9BQK8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LPIN3Q9BQK8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LPIN3Q9BQK8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPIN3Q9BQK8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPIN3Q9BQK8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 391.4 ms