Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LITAFQ99732 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LITAFQ99732 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LITAFQ99732 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LITAFQ99732 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms