Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX2Q99697 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITX2Q99697 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITX2Q99697 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX2Q99697 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms