Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KC1Q96S38 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KC1Q96S38 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KC1Q96S38 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KC1Q96S38 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KC1Q96S38 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KC1Q96S38 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms