Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP4Q96P64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP4Q96P64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP4Q96P64 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms