Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2E2Q96LR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2E2Q96LR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E2Q96LR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 785.6 ms