Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NXPE2Q96DL1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXPE2Q96DL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXPE2Q96DL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE2Q96DL1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms